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用串联质谱的方法分析正常人晶状体纤维蛋白质组数据
作者:张春巍 刘…  文章来源:150001 哈尔滨医科大学附属第一医院眼科医院  点击数3892  更新时间:2006/7/11 16:45:53  文章录入:zcw1229  责任编辑:毛进
[摘要]目的 运用蛋白质组技术鉴定和分析正常人眼晶状体纤维的蛋白质,建立正常人晶状体纤维的蛋白质组数据库和表达谱,为研究晶状体疾病提供基础。方法 晶状体纤维全蛋白质通过聚丙稀酰胺凝胶电泳初步分离,电泳凝胶分成6段,胶内酶切后的多肽通过液相色谱串联质谱的方法,对正常人晶状体中的全部纤维蛋白质进行鉴定。根据高丰度离子的匹配率、匹配离子的连续性和随机性得分,通过SEQUEST和AMASS软件筛选结果。同一样品平行做三次实验。结果 具有可信度在98%以上,有2个或2个以上合格谱图,不少于两次实验均鉴定的蛋白质作为阳性结果,共61个蛋白质。根据SWISS-PROT蛋白质数据库,15个鉴定蛋白质曾在以前的晶状体蛋白质研究中被报道;有46个蛋白质首次用蛋白质组学方法在人晶状体中被鉴定。结论 为晶状体纤维的蛋白质随年龄而变化以及白内障形成机理的探索奠定基础。聚丙稀酰胺凝胶电泳伴随液相色谱串联质谱是简单、快捷的方法,将在大规模的临床样品研究中具有良好的应用前景。
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